您提到的肱骨骨折术后骨头内钉子无法取出的情况，确实可能对伤残鉴定产生影响。根据《工伤保险条例》及相关规定，残疾等级鉴定一般在治疗终结出院后3个月到6个月才能鉴定。若钉子无法取出，可能被视为治疗未终结，或影响关节功能评估。因此，在申请伤残鉴定时，需明确说明此情况，并等待医疗机构确认治疗是否真正终结，再行申请。
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若钉子无法取出，申请伤残鉴定时，应首先确保已达到医疗期，并收集所有医疗记录和诊断证明。然后，向当地劳动能力鉴定委员会提出申请，说明钉子无法取出的情况。委员会将根据具体情况，可能需要您进行额外的医学检查或评估。最后，等待鉴定结果，并根据结果申请相应的工伤待遇。
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从法律角度看，钉子无法取出是否构成医疗事故需具体分析。若医生在手术过程中未尽到应有的注意义务，导致钉子无法取出并给患者造成损害，则可能构成医疗事故。但若是因患者体质、病情特殊等不可抗力因素导致，则不构成医疗事故。如有争议，建议通过医疗事故鉴定程序进行认定。